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日開發(fā)新軟件可追溯細胞的起源

追蹤一個細胞的活動極其重要,近日日本福井大學(xué)沖昌也、吉田俊之等教授領(lǐng)導(dǎo)的研究小組開發(fā)出一種新軟件,可在計算機畫面上直觀個體細胞分裂、增殖的全過程,由此可追溯細胞的起源,該軟件的開發(fā)成功可進一步促進再生醫(yī)療的研究。

專家稱,該軟件能夠追蹤從本人開始今后十五代子孫后的細胞,更新了至今僅能追蹤到第四代細胞的歷史。目前在ips細胞(萬能細胞)、胚胎干細胞(ES細胞)等用于再生醫(yī)療領(lǐng)域中,有必要納入表觀基因思路。

研究人員將可視綠色熒光蛋白質(zhì)(GFP)的酵母撒在培養(yǎng)盤里,經(jīng)電荷耦合器件攝像機(CCD)每隔兩分鐘攝像發(fā)現(xiàn),自同親緣細胞分裂出的子細胞呈相同色,由此可追溯細胞的起源,同時還可分析在各種環(huán)境下細胞的變化過程。

至今分析軟件識別細胞準確率僅達60%左右,誤差較大,在系統(tǒng)未能識別情況下,還需人工錄入數(shù)據(jù),而新軟件可以做到全自動化分析,精度也大幅度提高。此外,新軟件引用了表觀基因概念,即:據(jù)環(huán)境變化,特殊分子結(jié)合成DNA等時基因活動會發(fā)生變化,即便是相同基因,細胞內(nèi)生成的蛋白質(zhì)可能不同。

新軟件還改變了傳統(tǒng)分析方法,以前為了看清每個細胞而數(shù)數(shù),分析一個24小時時段的圖像數(shù)據(jù)需要1周時間,采用新軟件后,分析時間縮短為2個小時左右。

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