PyroMark Q24 焦磷酸測(cè)序儀采用成熟的焦磷酸測(cè)序技術(shù),在遺傳分析和表觀遺傳的甲基化研究中進(jìn)行基于序列的實(shí)時(shí)檢測(cè)和定量,獨(dú)特的PyroMark系統(tǒng)僅需數(shù)分鐘即可提供可靠的定量和測(cè)序結(jié)果。PyroMark Q24是集測(cè)序、樣品制備、試劑和對(duì)照以及完整和靈活的軟件于一體的系統(tǒng),非常適用于二、三和四等位基因突變以及連續(xù)CpG位點(diǎn)分析及定量。相比于Sanger測(cè)序需在測(cè)序前進(jìn)行耗時(shí)的PCR產(chǎn)物克隆,PyroMark Q24則在15分鐘的時(shí)間內(nèi)可完成1-24個(gè)樣品的序列分析及高度準(zhǔn)確的定量。
原理和功能:
1、PyroMark Q24 序列分析儀:利用亞硫酸氫鹽法和焦磷酸測(cè)序——其原理是根據(jù)所有未甲基化的C經(jīng)亞硫酸氫鹽處理和PCR之后全部轉(zhuǎn)化成T,然后通過(guò)焦磷酸測(cè)序,對(duì)比處理和未處理的PCR產(chǎn)物來(lái)確定DNA的甲基化情況。PyroMark Q24在甲基化試驗(yàn)中能**定量單個(gè)CpG位點(diǎn),能夠在混合的細(xì)胞群體中定量常見(jiàn)和稀有突變以及等位基因頻率,且甲基化分析和SNP分型可整合在一次實(shí)驗(yàn)中完成。
2、PyroMark Q24 真空工作站:用于制備單鏈DNA——從PCR產(chǎn)物到測(cè)序即用的單鏈模板,利用PyroMark Q24真空工作站可在15分鐘內(nèi)平行處理多至24個(gè)樣品且可靠的流程有助于避免樣品批次間的DNA交叉污染。在工作站中生物素標(biāo)記的PCR產(chǎn)物與鏈霉素親和素包被的樹(shù)脂微珠相結(jié)合,微珠隨后被Vavuum Prep Tool捕獲并徹底清洗,產(chǎn)生適合測(cè)序的單鏈DNA。
3.PyroMark Q24 軟件:安裝在PC上的此款軟件可對(duì)同一塊板上的樣品采用兩種模式進(jìn)行分析——CpG和AQ(等位基因定量),AQ模式可分析單個(gè)和多變位點(diǎn)以及二重、三重和四重等位基因突變,CpG模式可分析多個(gè)連續(xù)的CpG位點(diǎn)并提供了亞硫酸氫鹽處理的內(nèi)置參照。利用設(shè)計(jì)軟件可以對(duì)引物進(jìn)行設(shè)計(jì),使其中一條引物帶上生物素標(biāo)記以利于生成的PCR產(chǎn)物在樣品制備時(shí)被固定在微珠上。此外,軟件還提供了參考序列模式,給出包括預(yù)計(jì)峰位置和預(yù)計(jì)峰高度的信息,運(yùn)行之后,根據(jù)此信息對(duì)單個(gè)位點(diǎn)以及序列背景進(jìn)行質(zhì)量評(píng)估。
產(chǎn)品應(yīng)用:
通過(guò)亞硫酸氫鹽處理和焦磷酸測(cè)序進(jìn)行甲基化程度和等位基因頻率分析,發(fā)現(xiàn)稀有突變和CpG位點(diǎn)以及SNP分型,是表觀遺傳學(xué)和癌癥研究的有力工具。
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