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基因表達分析好幫手:iReport?

號稱全球**的PCR 組合佳補充——Ingenuity? iReport? 正式與2012年進入商業(yè)運作,該工具僅售495美元,能讓用戶以快速度了解到他們實驗數(shù)據(jù)中的意義,且使用簡單方便,表現(xiàn)出色,是基因表達工作者的工作好幫手。

面向生命科學研究人員提供信息與分析解決方案的**供應商 Ingenuity Systems 1月24日宣布其獨立報告 Ingenuity? iReport? 進入商業(yè)運作。該報告能夠以快的方式讓用戶了解到表達數(shù)據(jù)的生物學意義。iReport 為基因表達數(shù)據(jù)的統(tǒng)計分析和生物學意義的闡述提供了一站式的綜合解決方案,無需額外的軟件、培訓、統(tǒng)計或信息學方面的專業(yè)知識。iReport 同時支持轉(zhuǎn)錄組測序技術 rna-seq 和微陣列基因表達數(shù)據(jù)。

iReport 僅售495美元,只占整個實驗成本的一小部分,但卻具有很大價值。研究人員只需將自己的數(shù)據(jù)上傳至 Ingenuity 網(wǎng)站,便可獲得一個交互式定制 iReport 的鏈接,這份 iReport 報告給出了差異表達基因以及受實驗影響大的**、功能、生物過程和通路。研究人員可以輕松獲知實驗數(shù)據(jù)的意義,并通過對基因進行交互式探索、可視化和篩選,找出可用來進行追蹤研究的基因。為結(jié)果提供支持的 Ingenuity? Knowledge Base 是一項由人工審查的數(shù)據(jù)庫,包含百萬條取自經(jīng)同行評審的文獻和常用數(shù)據(jù)庫的生物及化學研究發(fā)現(xiàn)。iReport 使研究人員可以檢驗支持性的文獻證據(jù)、做筆記、共享報告、導出圖像用于出版并在購買前進行免費預覽。

俄勒岡州立大學 (Oregon State University) 博士后 Sumit Punj 表示:“這款 Ingenuity iReport 工具十分出色,對全世界特定條件下基因表達的變化進行了總結(jié)。對統(tǒng)計信息完善的結(jié)果做出清晰透徹的描述幫助我快速找出與細胞通路、過程和**有關的候選目的基因。直觀的設計和簡單的教程讓像我這樣的新用戶可以快速掌握報告的格式,并在幾分鐘之內(nèi)熟練瀏覽整個報告。iReport 縮短了我從微陣列實驗中獲取生物學意義的過程?!?/p>

德克薩斯大學加爾維斯頓醫(yī)學分部 (University of Texas Medical Branch at Galveston) 生物化學和分子生物學助理教授、核心實驗室主任 Russ Carmical 博士表示:“iReport 正在將結(jié)果反饋給我的客戶。一般客戶都沒有時間或相關知識背景來熟練掌握進行基因表達分析所需的、市場上可以買到的軟件包。iReport 簡化了整個分析過程,使我們能夠及時向客戶提供一個透徹且易于理解的報告。”

OvaGENE Oncology **科學官 William Ricketts 評論說:“iReport 用起來很簡單,也很直觀,讓我迅速掌握了數(shù)據(jù)的生物學意義,不需要花時間來處理復雜的統(tǒng)計數(shù)據(jù)。簡而言之,iReport 幫助我看到了通常被統(tǒng)計數(shù)據(jù)所掩蓋的生物學意義?!?/p>

Ingenuity iReport 針對一系列儀器平臺和實驗目標進行了優(yōu)化,包括微陣列、RNA-Seq、QPCR 和其它的組學平臺。iReport 可通過核心實驗室或直接向 Ingenuity 購買。有意購買 iReport 或了解詳情的研究人員請瀏覽 www.ingenuity.com/getireport/ 。

Ingenuity? Systems 簡介

Ingenuity Systems 是面向生命科學研究人員、計算生物學家、生物信息科學家和生命科學行業(yè)供應商提供信息解決方案和定制服務的**供應商。垂詢詳情,請訪問:www.ingenuity.com 。

實時 PCR Ingenuity iReport

2012年4月9日,Ingenuity Systems 和 Life Technologies Corporation 發(fā)布針對 TaqMan? Gene Expression Assays 經(jīng)過優(yōu)化的實時 PCR Ingenuity iReport。這個新解決方案是一個交互式報告,使分析不會局限于 Ct 或倍數(shù)變化,而是提供與基因表達實驗相關的生物信息的**、動態(tài)觀點。

位于瑞典哥德堡的 TATAA Biocenter 的創(chuàng)始人 Mikael Kubista 博士研究了單細胞星形膠質(zhì)細胞中的基因表達。“在我們的研究中,我們采用了特殊策略來分析單細胞數(shù)據(jù)并根據(jù)qPCR(定量 PCR)測量的基因表達之間的關系確定了重要的基因集。將這些數(shù)據(jù)上傳到 iReport,我們就能立刻發(fā)現(xiàn)潛藏在我們統(tǒng)計數(shù)據(jù)中的生物學,并根據(jù)有關我們單細胞實驗中涉及的差異表達路徑提出新的假設?!?/p>

與以往將實驗處理結(jié)果的時間浪費在人工檢索不同的是,iReport 能夠讓實驗室工作人員在一刻鐘之內(nèi)輕松得到所需的實驗數(shù)據(jù),Life公司的分析主管認為這是行業(yè)內(nèi)表現(xiàn)優(yōu)異的PCR組合補充,而且其電子商務體驗也會很棒。

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